新活檢方法用RNA識別早期癌症

來源:科技日報

原標題:新活檢方法用RNA識別早期癌症

美國芝加哥大學團隊開發了一種更爲靈敏的液體活檢技術,該方法利用RNA而不是傳統的DNA來檢測癌症。這一創新方法在使用患者血液樣本進行測試時,識別出早期結直腸癌的準確率達到95%,顯著優於現有的非侵入性檢測手段。這項研究發表於最新一期《自然·生物技術》雜誌。

當腫瘤細胞死亡並分解時,它們會將遺傳物質釋放到血液中。目前的標準液體活檢技術主要依賴於這些漂浮的DNA片段,即循環遊離DNA(cfDNA),來進行癌症檢測。然而,在疾病早期階段,由於腫瘤細胞仍在快速增殖,血液中的cfDNA含量往往較少,這限制了早期診斷的準確性。

與之不同的是,分析RNA可以提供關於基因活動的重要線索,因爲RNA的存在,表明細胞正在積極地工作和構建蛋白質。

此次團隊探索了使用循環遊離RNA(cfRNA)而非cfDNA的可能性。通過對結直腸癌患者的樣本進行分析,團隊不僅檢測出人類細胞cfRNA的修飾情況,還發現了腸道微生物羣落產生的RNA。人體消化系統內居住着數十億計的細菌,隨着癌性腫瘤的發展,這些微生物的行爲也會發生變化。研究表明,RNA修飾水平能夠反映生物體的狀態:越活躍的生物體,某些RNA的修飾就越頻繁。同樣模式也在結直腸癌樣本中得到了驗證。

進一步的研究揭示,癌症患者與健康個體之間,由微生物釋放的RNA存在顯著差異。隨着腫瘤增長,其周圍的微生物羣落必須適應炎症環境,導致微生物羣落更新速度加快,更多的細胞死亡並將RNA片段釋放到血液中。這意味着,基於微生物RNA修飾水平的檢測可能比依賴人類腫瘤細胞釋放DNA的方法更早發現潛在的癌症跡象。

市面上現有檢測糞便中DNA或RNA丰度的測試方法,檢測晚期癌症的準確率約爲90%,但檢測早期癌症的準確率則降至50%以下。相比之下,基於RNA修飾的新方法總體準確率接近95%,並且對早期癌症同樣有效。(記者張夢然)